Villacorta pertenece al amplio grupo de topónimos castellanos formados por la combinación de VILLA y un segundo elemento calificativo. En este caso, el segundo componente es el adjetivo corta, femenino de corto, procedente del latín CURTUS 'cortado, reducido, pequeño'. El significado originario del conjunto debió de ser, por tanto, "villa pequeña" o "población de reducidas dimensiones", en oposición implícita a otros núcleos de mayor extensión o importancia.

Este tipo de formación, aunque mucho menos frecuente que otras como Villanueva, Villamayor o Villamediana, responde al mismo procedimiento de caracterización mediante un adjetivo calificativo. El adjetivo no describe aquí un rasgo físico concreto del terreno, sino una cualidad atribuida al propio asentamiento, probablemente relacionada con su tamaño o con la extensión de su término en el momento de la denominación.

Desde el punto de vista etimológico, como se ha señalado, corto es la continuación patrimonial del latín CURTUS, que experimentó la evolución fonética regular hacia el castellano. El topónimo Villacorta constituye, por ello, un ejemplo de creación romance medieval en la que un adjetivo de uso común se incorpora a villa para individualizar un nuevo núcleo de población mediante una denominación de carácter descriptivo.