Son diversas las propuestas etimológicas que se ha presentado para Azara (Miguel_2015, p. 87), si bien son dos las más verosímiles. Por una parte, se ha planteado que procede del árabe andalusí zahrā ‘brillante, resplandeciente’, 'flor', del mismo modo que Zahara, Azahara (Cádiz, Granada) (vid. Corriente_Toponymes, p. 89; Pocklington_nombres, p. 171), solo que, en el caso del topónimo aragonés, con reducción vocálica interior y prótesis inicial. Pero, por otra, cabe derivarlo del árabe andalusí aṣ-ṣaḫra 'roca, peña' (Corriente_Toponymes, p. 44; Barceló_2010, p. 48; también Terés_Nómina, p. 356), del mismo modo que Azagra (Navarra), Zagra (Granada) o Sagra (Alacant). En este punto, debemos hacer referencia a la primera documentación del topónimo, datada en 1095, en la que aparece la forma Azahra, que se repite en 1101 y 1104 (CDPIAr, pp. 234, 353, 354 y 404). Además, en un manuscrito de 1137, al parecer copia de un original no conservado, se rectifica la transcripción del topónimo en la forma Azahara (cf. Medina Azahara), mucho más nítida formalmente que Cazahra, la que realmente anotó el amanuense y que se desechó considerando que se equivocó al copiar el texto original (DRamiro II, pp. 123-124). Desde nuestro punto de vista,  esa variante desechada, junto con las más antiguas, dan la clave para entender que el origen de Azara está realmente en aṣ-ṣaḫra 'roca, peña', propuesta que queda más que justificada, si tenemos en cuenta que su núcleo de población se levanta junto a una peña prominente, la llamada de Santa Margarita. 
En cuanto a la propuesta de Miguel (2020: 164), según la cual este topónimo procedería del antropónimo latino Atiarius (derivado de Atius), hay que indicar que tal nombre personal no está documentado; además, algunas de las formas medievales anotadas, difícilmente se justificarían a partir de ese étimo.