El topónimo Villaescusa aparece bastantes veces en una zona de España que, en líneas generales, abarca las provincias de Cantabria, Burgos, Palencia, Zamora, Cuenca y Guadalajara. Se relacionará más abajo, en el apartado de cognados, todos o casi todos los topónimos existentes actualmente. Naturalmente no todos son independientes, pues en algún caso podemos encontrarnos con repoblaciones que conllevaban el traslado de un topónimo más norteño anterior.

Se trata, pues, de un topónimo importante, pero bastante oscuro. Puede decirse, aún a riesgo de simplificación, que son dos las hipótesis para el segundo elemento del compuesto, pues el primero es bien conocido.

(1) La primera posibilidad, quizá la más extendida y difundida, quiere ver en el adjetivo -escusa el resultado del latín ABSCŌNSA, participio de pasado del verbo ABSCONDO, "esconder", "apartar". Este participio latino habría sido después suplantado en castellano por uno nuevo escondido,-a, con el acento ya en el sufijo, no en la raíz. Sería, pues, un participio arcaico. La denominación haría referencia a la localización de estas villas en lugares apartados, recónditos, de acceso más o menos difícil. La hipótesis no es inverosímil, pero se enfrenta a inconvenientes fonéticos de importancia, pues el cierre de /o/ en /u/, que aparece en todos los casos, es sorprendente; también lo es el paso de /a/ a /e/ en la sílaba inicial. No son dos hechos totalmente imposibles, pero juntos hacen la hipótesis un tanto débil. Desde el punto vista semántico es cierto que hay algún otro caso de escondida, escondido en la toponimia de lengua castellana, pero ciertamente no existe nunca **Villaescondida.

(2) Una segunda posibilidad sería considerar que escusa está por excusa, esto es, el participio fuerte del verbo excusar. Este participio está plenamente documentado, en contextos precisamente jurídicos, para designar a las personas eximidas, liberadas de alguna obligación o impuesto. De alguna manera entraría el topónimo en el campo semántico de las Villafranca igualmente abundantes. Esta hipótesis tiene la ventaja de no proponer una forma latina no documentada como tal en romance castellano, sino una forma plenamente romance, sin evolución fonética alguna. Al margen de ello, los topónimos se insertan entonces en una serie abundante y en un contexto histórico-social bien conocido, el de las villas que obtenían algún tipo de regalía o favor real. 

No es fácil elegir entre estas dos posibilidades, pero con dudas nos inclinamos por la segunda. Puede verse algo más de argumentación a este propósito más abajo.